Our principal Investigator Prof Wolfram Ruf of the University Medical Center Mainz has been elected as the next president of the International Society on Thrombosis and Hemostasis (ISTH).
The ISTH is the leading worldwide organization dedicated to the advancement of the understanding, prevention, diagnosis and treatment of thrombotic and bleeding disorders.
Dissemination of inflammatory cells and molecules from the intestine to downstream and distal organs
08.05.2024, 17 - 17:45 Uhr
Emil R. Unanue Professor of Immunobiology, Department of Pathology
Washington University in St. Louis, USA
Modern lipidomics approaches for clinical and preclinical research and profiling
18.04.2024, 17 - 17:45 Uhr
Clinical Lipidomics Unit, Institut für Physiologische Chemie
Universitätsmedizin Mainz
curAFellows richten sich an Student:innen, die erste praktische Erfahrungen in interdisziplinären Forschungsprojekten im Bereich translationaler Forschung sammeln möchten. Eine einzigartige Möglichkeit um schon früh einen wertvollen Beitrag zur Bekämpfung der Atherothrombose zu leisten.
Der 1. curATime Hackathon wird am 08.+09.04.2024 im Gutenberg Digital Hub, Mainz, stattfinden.
Gemeinsam werden junge Wissenschaftler, Bioinformatiker und Healthcare-Begeisterte Herausforderungen aus der Forschung des curATime Clusters angehen. Mehr Informationen hier.
Die curATalk-Vortragsreihe wurde 2021 ins Leben gerufen, um die an curATime beteiligten, sowie thematisch eng verwandten Forschenden und deren wissenschaftliche Expertise miteinander zu vernetzen. Dieses virtuelle Treffen findet in regelmäßigen Abständen statt und veranschaulicht die neuesten Forschungsergebnisse und Themen, die einen wissenschaftlichen Mehrwert für die einzelnen curATime-Projekte bieten. Die curATalks werden öffentlich angekündigt und erfreuen sich somit der regen Beteiligung eines diversen Publikums.
Dissemination of inflammatory cells and molecules from the intestine to downstream and distal organs
08.05.2024, 17 - 17:45 Uhr
Emil R. Unanue Professor of Immunobiology, Department of Pathology
Washington University in St. Louis, USA
Modern lipidomics approaches for clinical and preclinical research and profiling
18.04.2024, 17 - 17:45 Uhr
Clinical Lipidomics Unit, Institut für Physiologische Chemie
Universitätsmedizin Mainz
Macrophage-targeted RNA therapeutics
15.01.2024, 17 - 17:45 Uhr
Prof. Dr. Dr. Stefan Engelhardt
Institut für Pharmakologie und Toxikologie
Technische Universität München
Sprecher des CNATM Clusters
Microbiota and Arterial Thrombosis
08.11.2023, 17 - 17:45 Uhr
Jun.-Prof. Dr. Christoph Reinhardt
Centrum für Thrombose und Hämostase
Universitätsmedizin Mainz, Germany
Protein Protein interaction prediction in our AI based Genomics and Proteomics Sequence Analysis Framework
08.08.2023, 17 - 17:45 Uhr
Dr. Muhammad Nabeel Asim
DFKI GmbH
Kaiserslautern, Germany
Breaking Tolerance: The Autoimmune Aspect of Atherosclerosis
12.06.2023, 17 - 17:45 Uhr
Prof. Dr. Klaus Ley
Immunology Center of Georgia
Augusta University, USA
Synthetic regeneration at the heart of reversible reprogramming
25.05.2023, 17:00 - 17:45 Uhr
Dr. Johnny Kim
TRON gGmbH, Mainz
Blockchain as Digital Access Gate to Medical Data
21.03.2023, 17:00 - 17:45 Uhr
Dr. Markus Jostock
Arxum GmbH, Kaiserslautern
Acute coronary syndrome – novel pathophysiologic insights call for precision prevention
17.01.2023, 17:00 - 17:45 Uhr
Prof. Dr. David M. Leistner
Med. Clinic 3 – Cardiology, Angiology, University Hospital Frankfurt
„Humoral“ Immunity and Immune Homeostasis in Atherosclerosis
23.11.2022, 17:00 - 17:45 Uhr
Prof. Dr. Christoph Binder
Department of Laboratory Medicine Medical University of Vienna & Center for Molecular Medicine of the Austrian Academy of Sciences
Macromolecular strategies for enhancing immunotherapy responses to treat cardiovascular diseases
06.09.2022, 17:00 - 17:45 Uhr
Julius Maximilian University Würzburg
Inflammation of the heart: Mechanism and therapeutic options
21.07.2022, 16:00 – 16:45 Uhr
Prof. Dr. med. Florian Leuschner
Heidelberg University Hospital
Atherothrombosis: the impact of clotting proteases
21.06.2022 17:30 - 18:15 Uhr
Prof. Hugo ten Cate
CARIM, Maastricht University Medical Center+
RNA therapeutics in cardiovascular disease
12.04.2022, 17:00 - 18:00 Uhr
Prof. Dr. Stefanie Dimmeler
Goethe- University, Frankfurt
Institute of Cardiovascular Regeneration, Centre for Molecular Medicine
Chemometrics strategies and tools in Precision Medicine
23.03.2022 17:30 - 18:15 Uhr
Prof. Johan Trygg
Departmentof Chemistry, Umeå University, Umeå, Sweden
Corporate Research, Sartorius, Umeå, Sweden
Artificial CRISPR, an AI based approach to predict signature drug response from multi-omics datasets
22.03.2022, 17:30 - 18:15 Uhr
Prof. Dr. Jürgen Scheele
Chief Medical Officer Innoplexus AG
Advancing Robust Signal Processing and Statistical Learning for Biomedical Applications
15.02.2022, 17:30 - 18:15 Uhr
Prof. Dr.-Ing. Abdelhak Zoubir
Signal Processing Group, Technical University of Darmstadt
Human gut microbiota variation in health and disease
02.02.2022, 17:00 – 17:45 Uhr
Laboratory of Molecular Bacteriology (Rega Institute), KU Leuven, Belgium
Symptoma – Every patient deserves the right diagnosisand treatment
24.01.2022, 17:00 - 17:45 Uhr
Dr. med-univ. Jama Nateqi
Mass spectrometry-based proteomics in translational research and systems medicine
15.12.2021, 17:30 – 18:15 Uhr
Univ.-Prof. Dr. rer. nat. Stefan Tenzer
Institut für Immunologie, Universitätsmedizin Mainz
Innovationen für die Zukunft von Life Science und Medizin
Der curAHack hat junge Wissenschaftler, Bioinformatiker und Healthcare-Begeisterte zusammengebracht, um Herausforderungen aus der Forschung des curATime-Clusters anzugehen. Unter Anleitung von Mentor:innen und Expert:innen haben die Teilnehmenden innerhalb von zwei Tagen innovative Lösungen entwickelt und am Ende der Veranstaltung einer Jury präsentiert. Infos zur Veranstaltung und den Challenges sind hier zu finden.
Die Mentoren der drei Challenges ziehen eine begeisterte Bilanz:
"Team 1, "curAGUI" musste eine grafische Benutzeroberfläche erstellen, die alle zur Verfügung gestellten Platzhalterskripte implementieren konnte, um sie anschließend durch trainierte Deep-Learning-Modelle zu ersetzen. Das Team war in der Lage, ein Grundgerüst zu entwickeln, das alle erforderlichen Punkte umfasste und Videos in einer Weise integrierte, die die Ergebnisse der Pipeline nachahmte." Aida Romano Martínez, Universitätsmedizin Mainz
"Während des Hackathons arbeiteten zwei Teams an einer RNA-seq-Analysepipeline, die für die anfängliche Analyse keine Informationen zur Genannotation erfordern sollte. Beide Teams waren in der Lage, explorative Analysen durchzuführen, um die Auswirkungen verschiedener Ensemble-Genannotationsmodelle zu quantifizieren. Als Lösung haben beide Teams k-mer-Zähltabellen als Zwischenergebnisdatei entwickelt, die später auf jede beliebige Genannotation abgebildet werden kann.
Während das eine Team, die "Bioinformagicians", eine Analysepipeline mit vorhandenen Tools erstellte, die sie geschickt auswählten und für den beabsichtigten Zweck anpassten, entwickelte das andere Team, die "Expressionists", eine neuartige Analyse von Grund auf. Die "Bioinformagicians" gewannen schließlich den Hackathon mit einer kombinierten Analyse, die die Grundlage für die Entwicklung einer neuen Expressionspipeline für RNA-seq-Daten bilden könnte. Wir werden alle Ergebnisse und Erkenntnisse in einem Preprint zusammenfassen und alle Daten, den Code und die Analyse als öffentliches Repository und auf einem Preprint-Server zur Verfügung stellen."
Dr. David Weber, TRON gGmbH
"Die Hackathon-Herausforderung "Target Sequence for RNA delivery" wurde von dem Team "CurApollo13" in Angriff genommen, das Peptidsequenzen identifizieren wollte, die einen gezielten Transport von Nanopartikeln zu Endothelzellen in atherosklerotischen Läsionen ermöglichen könnten. Ohne jegliche Vorkenntnisse oder Rechenressourcen entwickelte das Team zwei kreative und doch komplementäre Konzepte. Ein Ansatz bestand in der Analyse der 3D-Proteinstrukturen von Paratop/Epitop-Paaren.
In einem zweiten Ansatz stellte das CurApollo13-Team ein Konzept vor, bei dem 3D-Strukturen von zufälligen kurzen Peptidsequenzen mit Hilfe von AlphaFold, einer leistungsstarken Berechnungsmethode zur Simulation von 3D-Proteinstrukturen, rechnerisch vorhergesagt werden können. Diese mutmaßlichen Strukturen könnten dann Antigenen überlagert werden, um ihre mutmaßliche Bindung zu testen. Im Prinzip könnte der erste Ansatz zur Validierung des zweiten, vollständig rechnerischen Ansatzes verwendet werden. Das Team CurApollo13 belegte den zweiten Platz beim curAHack."
Dr. Johnny Kim, TRON gGmbH
curAHack 2024 am Gutenberg Digital Hub im Mainzer Zollhafen
